Básicamente el ejercicio en ayunas anda bien para el tema lipolitico por que tus células se encuentran depletadas de glucógeno y es mas fácil alcanzar la lipolisis en términos hormonales. Pero es recomendable para ejercicios de baja y/o moderada intensidad. Como planteaste arriba los burpees son de alta intensidad, los cuales fomentan la depleción de glucógeno, el cual no tienes, es por esto que entras en un estado catabólico antes de tiempo. La idea de los intervalos, es aumentar el metabolismo, pero esto ocurre en gran medida, post ejercicio. Al igual que la mayor parte del proceso lipolitico. Tiene sus pro y sus contras, pero el ayuno y los entrenamientos en alta intensidad generalmente no van de la mano, ya que se requiere tener motor para tu auto F1. Mi recomendación, es que si realizaras ejercicio intenso en ayunas (independientemente la hora, es que comas idealmente un poco de carbohidratos con proteína 45 - 1hr antes del ejercicio) de lo contrario, deberás moderar la intensidad de tu actividad a algo mas aerobico. Saludos